我院以医道天德为办院理念，以提高自主创新能力、综合服务能力为目标，以临床能力、科研能力建设为核心，积极探索建立适合于中医药特点和中医临床需求的科研组织模式和运行机制，不断彰显中医药优势，扩大中医药的国内外影响，为人们提供更加满意的中医药服务。

国家级重点学科、重点研究室建设是国家中医药管理局根据中医药事业发展的重大科技需求，针对制约中医药发展的关键理论和共性技术问题而设立的代表国家水平的研究基地，是国家中医药科技创新体系的重要组成部分。目前我院现有1个国家中医药管理局重点研究室（老年性痴呆调补心肾）；4个国家中医药管理局重点学科（中药药理学、中药化学、中医老年病学、痹病学）； 6个国家中医药管理局重点专科（肺病科、老年病科、儿科、风湿病科、康复科、肾病科等），3个国家中医药管理局三级实验室（中药化学实验室、中药药理实验室和中药制剂实验室），中国中医药文献检索中心长春分中心；国家保健食品注册检验机构，国家示范转移机构，国家药品临床研究基地。同时我院有 “吉林省创新医药公共服务平台”、吉林省中药药效物质基础实验室、吉林省中药新药制剂工程研究中心、 吉林省长白山药材标准化工程研究中心、长白山地道药材工程实验室、吉林省保健食品研究工程实验室、吉林省首批博士后创业基地等省级平台。

经过五十多年建设发展走出了一条以重点学科（专科）为龙头、科研（产业）为支撑的特色办院之路，成就了今天集科研、临床、开发为一体的地方中医药科研机构，是吉林省唯一的一家中医药专业科研机构。